机关工勤退休人员因病死亡抚恤金由单位人事部门或社保部门支付。依据《工伤保险条例》等规定，抚恤金由单位人事或社保部门办理。不及时处理可能导致家属权益受损，影响生活稳定。
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抚恤金由人事或社保支付。具体操作：1. 准备死亡证明、火化证明等材料；2. 到单位人事部门或社保部门提交材料并申请；3. 人事或社保部门审核后，按规定发放抚恤金，包括丧葬补助费、直系亲属救济费等；4. 如遇问题，可咨询当地人社局或法律专业人士。
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处理机关工勤退休人员因病死亡抚恤金，可去单位人事或社保部门办理。选择方式需考虑家属实际情况及当地政策，单位人事部门更了解内部流程，社保部门则更专业全面。